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2022单细胞测序技术应用现状与投资前景

  • 2022年9月29日 HuangJiang来源:新浪 1030 65
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单细胞测序相关研究与日俱增。该技术已广泛应用于科研行业神经生物学、种系传播、器官生长、癌症生物学等多个领域的研究。

单细胞测序技术是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项技术。它能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性,在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用,正成为生命科学研究的焦点。

以前,需要从大量细胞中获取足够多的DNA进行测序,因此测序结果是这些细胞"整体"的表征。然而,由于细胞异质性,相同表型的细胞的遗传信息可能存在显著性差异,很多低丰度的信息会在整体表征中丢失。为了弥补传统高通量测序的局限性,单细胞测序技术应运而生。

单细胞测序相关研究与日俱增。该技术已广泛应用于科研行业神经生物学、种系传播、器官生长、癌症生物学等多个领域的研究。

2022单细胞测序技术应用现状与投资前景

近日,腾讯研究成果登《Nature》子刊:「scBERT」模型攻克单细胞测序数据分析痛点。

腾讯在论文中创新性地提出关于单细胞注释的“scBERT”算法模型,受到《Nature Machine Intelligence》杂志评审高度认可,表示该成果对于单细胞转录组测序数据分析领域未来研究具有深远意义。

单细胞测序技术是生命科学领域的一项革命性技术,可以细粒度地观察和刻画各个物种中组织、器官和有机体中单细胞分子图谱(细胞表达),便于更好地了解肿瘤微环境,以达到精细分析病因、精准匹配治疗方案的效果,对于“精准医疗”具有极高的应用价值。

值得注意的是,受数据样本量小、人工干预多、过度依赖marker gene(已报道的特异性基因)等因素的影响,单细胞测序细胞类型注释技术一直面临着泛化性、可解释性、稳定性均比较低的问题,现存的算法难以有更广泛的应用。

针对以上问题,论文中首次提出“基于大规模预训练语言模型的单细胞转录组细胞类型注释算法”,即“scBERT”模型,首次将“transformer”(自然语言处理算法经典计算单元)运用到单细胞转录组测序数据分析领域。

根据中研普华研究院《2022-2027年全球及中国单细胞测序行业发展调研及投资前景分析报告》显示:

2019年9月,美国单细胞测序公司10x Genomics在纳斯达克上市,IPO3.9亿美元,成为该领域的领头羊。国内单细胞测序行业发展较为滞后,但也颇受资本青睐。2019年3月,万乘基因完成五百万元天使轮融资;6月,百奥智汇完成A轮融资,新格元生物完成近亿元pre-A轮融资;10月,寻因生物完成数千万元pre-A轮融资。

单细胞测序即从单个细胞水平上对基因组进行测序,把基因测序应用到单个细胞层面,从而识别细胞的类型、功能,特定细胞健康或状态的变化、变异。而常规的基于NGS的基因检测,都是在大量细胞宏观水平上,对整个细胞群进行遗传分析。

在基因层面,单细胞测序可以获取更精准的遗传信息,在蛋白层面,通过分析单细胞表达的蛋白可以直接的获取人体免疫相关的靶点,用于免疫诊断、新药研发等。鉴于蛋白质不具有直接扩增的特性,以及蛋白质组学分析灵敏度的限制,单细胞蛋白分析的常见、有效技术是质谱分析,主要技术包括质谱流式细胞术(Mass Cytometry)、TOF-SIMS(飞行时间二次离子质谱仪)分析等。

质谱流式技术平台最初由美国DVS Science开发,但这家企业于2014年被美国Fluidigm以2.1亿美元收购。国内单细胞蛋白分析的代表企业为宸安生物、普罗亭,其中,宸安生物专注单细胞质谱流式诊断设备、试剂和软件开发,普罗亭致力于以单细胞蛋白层面研究为核心的检测服务。

无论是基因层面,还是蛋白层面,单细胞分析技术已然成熟,但囿于成本并未广泛应用于市场上,更多的是为科研提供服务。动脉网整理了全球单细胞行业的目前发展状况,以及单细胞技术在赢来大规模应用之前面临的挑战与机遇。

随着单细胞测序行业竞争的不断加剧,大型企业间并购整合与资本运作日趋频繁,国内外优秀的单细胞测序企业愈来愈重视对行业市场的分析研究,特别是对当前市场环境和客户需求趋势变化的深入研究,以期提前占领市场,取得先发优势。

《2022-2027年全球及中国单细胞测序行业发展调研及投资前景分析报告》由中研普华研究院撰写,本报告对该行业的供需状况、发展现状、行业发展变化等进行了分析,重点分析了行业的发展现状、如何面对行业的发展挑战、行业的发展建议、行业竞争力,以及行业的投资分析和趋势预测等等。报告还综合了行业的整体发展动态,对行业在产品方面提供了参考建议和具体解决办法。

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